Le Mont Nébo est le l’endroit où le prophète Moïse a vu la Terre Sainte sans y entrer : « Moïse monta des steppes de Moab au Mont Nébo, au sommet du Pisga, qui est en face de Jéricho. Le Seigneur lui fit voir tout le pays … Le Seigneur lui dit : « Ce pays que tu vois, j’ai juré à Abraham, à Isaac et à Jacob de le donner à leur descendance. Je te le fais voir, mais tu n’y entreras pas. » Moïse, le serviteur du Seigneur, mourut là, au pays de Moab, selon la parole du Seigneur. On l’enterra dans la vallée qui est en face de Beth-Péor, au pays de Moab. Mais aujourd’hui encore, personne ne sait où se trouve son tombeau. » Le Livre du Deutéronome (34, 1-6). Nos ancêtres ont rendu hommage à Moïse le prophète, des vestiges remontant au quatrième siècle en témoignent.
Le Mont Nébo est situé à l’ouest de la ville de Madaba et donne sur l’embouchure du Jourdain et la ville de Jéricho. La Bible mentionne le Mont Nébo, où Moïse le prophète est monté des steppes de Moab au sommet du Pisga. Le Seigneur lui a montré toute la Terre Promise par l’Éternel et l’a informé qu’il n’y entrerait pas. Il est mort au pays de Moab et enterré dans la vallée.
Nos ancêtres ont rendu hommage à Moïse le prophète, des vestiges en témoignent. La pèlerine de l’Espagne, lors de sa visite en Terre Sainte en 394, a mentionné le sanctuaire du prophète Moïse sur le Mont Nébo ainsi qu’un petit temple au sommet de la montagne qui a été érigé en sa mémoire. Toute la région dépendait du Patriarcat de Madaba.
L’évêque Pierre l'Ibère de Géorgie a écrit dans ses mémoires de pèlerinage, à la fin du cinquième siècle, qu’il y avait un grand temple érigé par les habitants de la région en l’honneur de Moïse le prophète.
Le sanctuaire, l’église et les monastères ont subi, tout comme le pays, des incidents politiques et militaires ainsi que des tremblements de terre. Le tremblement de terre en 551 a détruit l’église qui a été reconstruite en 597. Elle a été détruite à nouveau par les tremblements de terre en 1016 et 1033. En 1217, un touriste a mentionné qu’un petit nombre de chrétiens résidaient au Mont Nébo lors de son passage. En 1564, un moine franciscain l’a visitée. Il l’a décrite comme étant des ruines. En 1932, le Mont Nébo est devenu la propriété des gardiens de la Terre Sainte (les Pères franciscains).
Après fouilles, recherches et études, les archéologues ont pu lever le rideau sur l’histoire de ce lieu sacré. Au IVe siècle après J.-C., il était composé de 3 bâtiments voûtés sur le lieu actuel de l’autel. Il comprenait un certain nombre de tombes ornées de mosaïques. De part et d’autre de celle-ci se trouvaient deux églises pour les prières funéraires. Une grande croix ornait le sol de la partie méridionale. La partie septentrionale était également recouverte de mosaïques. Cette œuvre a été réalisée par les artistes Souheil, Quyam et Elias en 531 après J.-C. L’église comporte trois nefs a été construite sous Serge l’évêque de Madaba en 597. Une petite église en l’honneur de la Vierge Marie (Mère de Dieu) y a été adjointe en 608.